Freddy Fazbear's Pizzeria Simulator bắt đầu như một trò chơi 8 bit, trong đó người chơi phải điều khiển Freddy Fazbear, nhân vật chính của Five Nights at Freddy's, để phân phát pizza cho nhiều trẻ em. Trò chơi của phần đó của trò chơi cuối cùng kết thúc trong một " trục trặc ", đó là mục đích đầu vào.

Trò chơi sau đó chuyển sang một căn phòng tối nơi người chơi phải đối mặt với một Animatronic bị hỏng với ngoại hình giống với Circus Baby từ Five Nights tại Freddy's: Sister Location (gọi tắt là Scrap Baby Baby) . Một giọng nói từ một băng cassette hướng dẫn người chơi quan sát hoạt hình và ghi lại các phản ứng của chúng với các kích thích âm thanh khác nhau. Một danh sách kiểm tra phải được điền có chứa các tùy chọn "không", "có" và "không chắc chắn". Nếu người chơi cảm thấy animatronic sắp thực hiện một cú jumpscare, thì họ có thể khuất phục nó bằng cách giật điện nó.Tuy nhiên, Animatronic sẽ mất giá trị nếu nó bị giật nhiều hơn ba lần, làm giảm số tiền lãi có thể có được từ nó. Nếu người chơi thành công trong phần này của trò chơi, họ sẽ kiếm được phần thưởng bằng tiền mặt. Nếu không thành công, sẽ không có phần thưởng tiền mặt. Mặt khác, người chơi có thể từ chối trục vớt animatronic và loại bỏ nó. Người chơi phải hoàn thành nhiệm vụ này với một hoạt họa khác nhau sau mỗi bốn ngày đầu tiên trong trò chơi.

Phần giới thiệu giới thiệu có Đơn vị Hướng dẫn được hiển thị cho người chơi, sau đó trò chơi chuyển sang mô phỏng kinh doanh, nơi người chơi mua đồ trang trí cho nhà hàng hư cấu của họ và đặt chúng xung quanh nhà hàng. Mua các mặt hàng này có thể làm tăng không khí, sức khỏe / an toàn và tiêu chuẩn giải trí, với khả năng cũng mang lại cho họ thêm doanh thu. Tuy nhiên, nhiều trong số các mặt hàng này cũng có thể làm tăng trách nhiệm pháp lý và dẫn đến các vụ kiện có thể được đấu tranh hoặc giải quyết, cả hai đều phải trả giá. Lời đề nghị tài trợ có thể được chấp nhận vì tiền nhưng có thể gây mất tập trung âm thanh cho người chơi sau này trong trò chơi. Các trò chơi arcade được đặt trong nhà hàng cũng có thể được tương tác để chơi các trò chơi nhỏ.

Phần tiếp theo của trò chơi sẽ thấy người chơi sử dụng máy tính để hoàn thành các nhiệm vụ khác nhau để duy trì nhà hàng. Tuy nhiên, các Animatronic bị hỏng sẽ cố gắng tấn công người chơi. Chúng có thể bị ngăn lại bằng cách chiếu đèn pin của người chơi vào các lỗ thông gió hoặc bằng cách sử dụng âm thanh để dụ chúng ra chỗ khác.  Người chơi có thể sử dụng một mạng lưới các máy dò chuyển động để theo dõi chuyển động của các Animatronic từ vị trí này sang vị trí khác. Không giống như các phần trước trong sê-ri, cả bốn Animatronic trong trò chơi (Scrap Baby, Molten Freddy, William Afton và Lefty) đều có chung một hành vi thay vì việc có các cơ chế khác nhau.

Tiếng ồn từ máy tính và hệ thống thông gió chính che khuất âm thanh của chuyển động của hoạt hình. Người chơi có thể nâng cấp thiết bị văn phòng để tăng hiệu quả và giảm độ ồn. Ngoài ra, người chơi có thể chuyển sang hệ thống thông gió thứ cấp chạy êm hơn, nhưng không hiệu quả trong việc kiểm soát nhiệt độ. Bất kỳ tài trợ nào được chấp nhận sẽ khiến quảng cáo lớn được phát ngẫu nhiên trên máy tính, thu hút Animatronic và khiến người chơi không thể nghe thấy chúng hoặc làm bất cứ điều gì trong vài giây. Một ngày trong game sẽ kết thúc khi người chơi hoàn thành các nhiệm vụ và đăng xuất ra khỏi máy tính.

Trò chơi kết thúc sau sáu ngày đêm đã hoàn thành. Một số kết thúc khác nhau là có thể, tùy thuộc vào các yếu tố như mức độ cải thiện của tiệm bánh pizza, số vụ kiện được đưa ra chống lại tiệm bánh pizza của khách hàng và liệu người chơi có cứu vãn mọi hoạt hình hay không, trong số các điều kiện khác.